Universität Regensburg
Birte Kehr
Anschrift:
Frau Prof. Dr. Birte Kehr
Universität Regensburg
Fakultät für Informatik und Data Science
Algorithmische Bioinformatik, LIT - Leibniz-Institut für Immuntherapie (ehemals RCI)
Universität Regensburg
Fakultät für Informatik und Data Science
Algorithmische Bioinformatik, LIT - Leibniz-Institut für Immuntherapie (ehemals RCI)
Straße:
Franz-Josef-Strauß-Allee 11
Ort:
93053 Regensburg
Tel.:
0941 944-18161
Leistungsprofil:
Praxisrelevante Forschungsgebiete:- Algorithmen zum Auffinden genomischer Variation in Sequenzdaten, insbesondere Strukturvariation (Deletionen, Insertionen, Translokationen, Inversionen, etc.)
- Analyse verschiedener Arten von Sequenzdaten (z.B. Short-Read-, Long-Read-, Linked-Read-Daten)
- Analyse von DNA Rearrangements
Publikationen:
- Niehus S, Jónsson H, Schönberger J, Björnsson E, Beyter D, Eggertsson HP, Sulem P, Stefánsson K, Halldórsson BV, Kehr B. PopDel identifies medium-size deletions simultaneously in tens of thousands of genomes. Nature Communications 2021, 12:730.
- Björnsson E, Gunnarsdóttir K, Halldórsson GH, Sigurðsson Á, Árnadóttir GA, Jónsson H, Olafsdottir EF, Niehus S, Kehr B, Sveinbjörnsson G, Gudmundsdottir S, Helgadottir A, Andersen K, Thorleifsson G, Eyjolfsson GI, Olafsson I, Sigurdardottir O, Saemundsdottir J, Jonsdottir I, Magnusson OTh, Masson G, Stefansson H, Gudbjartsson DF, Thorgeirsson G, Holm H, Halldorsson BV, Melsted P, Norddahl GL, Sulem P, Thorsteinsdottir U, Stefansson K. Lifelong Reduction in LDL Cholesterol Due to a Gain-of-Function Mutation in LDLR. Circulation: Genomic and Precision Medicine 2021, 14(1):e003029.
- Kehr B, Helgadottir A, Melsted P, Jonsson H, Helgason H, Jonasdottir Ad, Jonasdottir As, Sigurdsson A, Gylfason A, Halldorsson GH, Kristmundsdottir S, Thorgeirsson G, Olafsson I, Holm H, Thorsteinsdottir U, Sulem P, Helgason A, Gudbjartsson DF, Halldorsson BV, Stefansson K. Diversity in non-repetitive human sequences not found in the reference genome. Nature Genetics 2017, 49(4):588-593
- Jonsson H, Sulem P, Kehr B, Kristmundsdottir S, Zink F, Hjartarson E, Hardarson MT, Hjorleifsson KE, Eggertsson HP, Gudjonsson SAA, Ward LD, Arnadottir GA, Helgason EA, Helgason H, Gylfason A, Jonasdottir As, Jonasdottir Ad, Rafnar Th, Frigge M, Stacey SN, Magnusson OTh, Thorsteinsdottir U, Masson G, Kong A, Halldorsson BV, Helgason A, Gudbjartsson DF, Stefansson K. Parental influence on human germline de novo mutations in 1,548 trios from Iceland. Nature 2017, 549(7673):519-522.
- Kehr B, Melsted P, Halldorsson BV. PopIns: population-scale detection of novel sequence insertions. Bioinformatics 2016, 32(7):961-967.
- Krannich T, White WTJ, Niehus S, Holley G, Halldórsson BV, Kehr B. Population-scale detection of non-reference sequence variants using colored de Bruijn Graphs. Bioinformatics 2022, 38(3):604-611.
Kooperationsangebot für die Wirtschaft / Praxis:
Bevorzugte Form der Kooperation:
- FuE
- Bachelor-/Master-/Diplomarbeit
- Doktorarbeit
Bestehende Kooperationen:
Mit Hochschulen:
Prof. J. Schulte, Prof. M. Schülke, Dr. M. Kircher
Charité-Universitätsmedizin Berlin
seit 2019
Prof. M. Weidlich
Humboldt Universität Berlin
seit 2020
Mit Unternehmen:
Prof. B. Halldórsson
deCODE genetics, Reykjavík
seit 2016
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