Universität Regensburg

Peter Oefner

Anschrift:

Leistungsprofil:

• Bioanalytische Chemie
• Umfassende und räumlich aufgelöste Stoffwechselanalysen mittels Massenspektrometrie und Kernspinresonanz
• Immun- und Tumorzellstoffwechsel
• Bioinformatik und Statistik von hochdimensionalen molekularen Datensätzen
• Chronische Nierenerkrankungen

• Umfassende MS und NMR basierte Analysen von Stoffwechselprozessen inkl. der Verfolgung von stabilen Isotopen
• Bioinformatik und Statistik von hochdimensionalen Daten unter Integration von klinischen Daten in der Diagnostik und Prognostik humaner Erkrankungen sowie in der Vorhersage therapeutischer Effekte

• 2x Agilent Technologies 6890N Network GC Systeme inkl. Agilent Technologies 5975 Inert Mass Selective Detectors, ein Gerät ist überdies mit dem Gerstel MultiPurposeSampler MPS2XL Twister ausgestattet
• 1x LECO Pegasus 4D GCxGC/TOF-MS System samt MultiPurposeSampler MPS2XL Twister
• 1x Waters MRT Select Series DESI/MALDI Imaging System
• 1x Bruker 600 MHz Bruker Avance III inkl. Kryokopf (5-mm TCI (1H, 13C, 15N, 2H) z-Gradient) und SampleJet Probenwechsler
• 1x AB SCIEX 4000 QTRAP LC/MS/MS System 1x AB SCIEX Exion LC-Triple Quad 6500+ System 1x AB SCIEX Ekspert nanoLC 425 - TripleTOF 5600+ System 1x Dionex UPLC - Bruker maxis impact qTOF System

Publikationen:

• Kohl L, Siddique MNAA, Bodendorfer B, Berger R, Preikschat A, Daniel C, Ölke M, Liebler-Tenorio E, Schulze-Luehrmann J, Mauermeir M, Yang KT, Hayek I, Szperlinski M, Andrack J, Schleicher U, Bozec A, Krönke G, Murray PJ, Wirtz S, Yamamoto M, Schatz V, Jantsch J, Oefner P, Degrandi D, Pfeffer K, Mertens-Scholz K, Rauber S, Bogdan C, Dettmer K, Lührmann A, Lang R. Macrophages inhibit Coxiella burnetii by the ACOD1-itaconate pathway for containment of Q fever. EMBO Mol Med 2023;15(2):e15931.
• Paulus MG, Renner K, Nickel AG, Brochhausen C, Limm K, Zügner E, Baier MJ, Pabel S, Wallner S, Birner C, Luchner A, Magnes C, Oefner PJ, Stark KJ, Wagner S, Maack C, Maier LS, Streckfuss-Bömeke K, Sossalla S, Dietl A. Tachycardiomyopathy entails a dysfunctional pattern of interrelated mitochondrial functions. Basic Res Cardiol 2022;117(1):45.
• Zacharias HU, Altenbuchinger M, Schultheiss UT, Raffler J, Kotsis F, Ghasemi S, Ali I, Kollerits B, Metzger M, Steinbrenner I, Sekula P, Massy ZA, Combe C, Kalra PA, Kronenberg F, Stengel B, Eckardt KU, Köttgen A, Schmid M, Gronwald W, Oefner PJ; GCKD Investigators. A Predictive Model for Progression of CKD to Kidney Failure Based on Routine Laboratory Tests. Am J Kidney Dis 2022;79(2):217-230.e1.
• Dowling JK, Afzal R, Gearing LJ, Cervantes-Silva MP, Annett S, Davis GM, De Santi C, Assmann N, Dettmer K, Gough DJ, Bantug GR, Hamid FI, Nally FK, Duffy CP, Gorman AL, Liddicoat AM, Lavelle EC, Hess C, Oefner PJ, Finlay DK, Davey GP, Robson T, Curtis AM, Hertzog PJ, Williams BRG, McCoy CE. Mitocondrial arginase-2 is essential for IL-10 metabolic reprogramming of inflammatory macrophages. Nature Communications 2021;12(1):1460.
• Siska PJ, Jiao J, Matos C, Singer K, Berger RS, Dettmer K, Oefner PJ, Cully MD, Wang Z, QuinnIII WJ, Oliff KN, Wilkins BJ, Christensen LM, Wang L, Hancock WW, Baur JA, Levine MH, Ugele I, Mayr R, Renner K, Zhou L, Kreutz M, Beier UH. Kynurenine induces T cell fat catabolism and has limited suppressive effects in vivo. EBioMedicine 2021;74:103734.
• Cheng Y, Schlosser P, Hertel J, Sekula P, Oefner PJ, Spiekerkoetter U, Mielke J, Freitag DF, Schmidts M, GCKD Investigators, Kronenberg F, Eckardt KU, Thiele I, Li Y, Köttgen A. Rare genetic variants affecting urine metabolite levels link population variation to inborn errors of metabolism. Nature Communications 2021;12(1):964.
• Petersen AØ, Jokinen M, Plichta DR, Liebisch G, Gronwald W, Dettmer K, Oefner PJ, Vlamakis H, Chung DC, Ranki A, Xavier RJ. Cytokine-specific autoantibodies shape the gut microbiome in autoimmune polyendocrine syndrome type 1. J Allergy Clinic Immunol 2021;148(3):876-888.
• Baier J, Gänsbauer M, Giessler C, Arnold H, Muske M, Schleicher U, Lukassen S, Ekici A, Rauh M, Daniel C, Hartmann A, Schmid B, Tripal P, Dettmer K, Oefner PJ, Atreya R, Wirtz S, Bogdan C, Mattner J. Arginase impedes the resolution of colitis by altering the microbiome and metabolome. J Clin Invest 2020;130(11):5703-5720.
• Schlosser P, Li Y, Sekula P, Raffler J, Grundner-Culemann F, Pietzner M, Cheng Y, Wuttke M, Steinbrenner I, Schultheiss UT, Kotsis F, Kacprowski T, Forer L, Hausknecht B, Ekici AB, Nauck M, Völker U, GCKD Investigators, Walz G, Oefner PJ, Kronenberg F, Mohney RP, Köttgen M, Suhre K, Eckardt KU, Kastenmüller G, Köttgen A. Genetic studies of urinary metabolites illuminate mechanisms of detoxification and excretion in humans. Nature Genetics 2020;52(2):167-176.
• Arlt A, von Bonin F, Rehberg T, Perez-Rubio P, Engelmann JC, Limm K, Reinke S, Dullin C, Sun X, Specht R, Maulhardt M, Linke F, Bunt G, Klapper W, Vockerodt M, Wilting J, Pukrop T, Dettmer K, Gronwald W, Oefner PJ, Spang R, Kube D. High CD206 levels in Hodgkin lymphoma-educated macrophages are linked to matrix-remodeling and lymphoma dissemination. Molecular Oncology 2019; 14(3):571-589.

Kooperationsangebot für die Wirtschaft / Praxis:

• Entwicklung und Validieren neuer Methoden für Metabolomik und Proteomik
• Präklinischen Studien

Bestehende Kooperationen: